徐骁教授团队:新建基于MobileNet v2神经网络的肝癌复发预警模型,提升手术疗效、改善患者预后

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研究简介


研究方法


该研究基于多示例学习(Multiple Instance Learning,MIL),附加细胞核特征训练MobileNet v2构建肿瘤复发预测模型。并在TCGA(n=302)与LT验证集(n=144)上验证MobileNetv2_HCC_Class模型预测效能。主要评价指标为无瘤生存率(RFS),模型性能评价的指标为时间依赖性曲线下面积(AUC)及净重新分类改善指数(NRI)。具体分析方法见图1。


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图1.研究流程与技术路线。



研究结果


基于MIL构建MobileNet v2_HCC_Class模型。TCGA验证集中,MobileNet v2_HCC_Class可以有效预测肿瘤复发高危患者。在单因素生存分析中,MobileNet v2_HCC_Class的高低危复发风险比(HR)为2.72(95%CI 1.98-3.75,P<0.001),在多因素生存分析中,HR为2.55(95%CI 1.64-3.99,P<0.001)。在TCGA中,肝切除术后预测肝癌复发的AUC详见图2A。在LT验证集中,MobileNet v2_HCC_Class在单因素生存分析中的HR为3.13[95%可信区间(CI)1.86-5.28,P<0.001],在多因素生存分析中HR为3.44(95%CI 2.01-5.87,P<0.001)。在LT验证集中,预测肝癌复发的AUC详见图2B。


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图2. MobileNet v2_HCC_Class模型在TCGA与LT验证集中的AUC:A,TCGA验证集;B,LT验证集

以美国癌症联合委员会(AJCC,简称Stage_referrence)分期为参考,TCGA验证集中在预测肝切除术后3年肝癌复发的NRI最佳为0.20;在LT验证集中MobileNetV2_HCC_class在预测LT后1.5年内肝癌复发的NRI最高为0.42(图3)。


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图3. MobileNet v2_HCC_Class模型在TCGA与LT验证集中的INR:A,TCGA验证集;B,LT验证集

综上,MobileNet v2_HCC_Class可以显著区分肝癌术后肿瘤高危复发与非高危复发患者,有效预测RFS。另外,预警模型提取肝癌复发的共有病理特征:肿瘤间质比例、细胞核高度异型性、细胞核深染和缺乏免疫细胞浸润。



研究结论


基于MobileNet v2网络构建的肝癌复发预警模型可以有效学习病理组织图像特征,在肝癌肝移植术后预测肿瘤复发上具有较好的应用价值。MobileNet v2_HCC_Class预警模型可预测生存结局,并精准识别肿瘤高复发风险病理特征,有助于甄别高危复发人群,便于随访管理与尽早干预等治疗措施,提升肝癌治疗疗效,改善患者预后
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研究者说

该论文通讯作者为徐骁教授,第一作者为刘治坤副主任医师。研究团队总结该论文主要创新点如下:


1.基于HE病理切片的人工智能分析表明,HE病理切片可以用于预测患者疗效、副反应、预后等。然而,HE病理切片不同区域的异质性,即同一位患者HE病理切片不同区域的标注不一定等同于患者的标注。这也是既往大部分研究无法克服的难题。该研究采用MIL,即学习者不是接收一组单独标注的实例,而是接收一组带标签的包,每个包拥有多个实例。MIL可有效克服病理切片标注问题


2.细胞核形态与大小等信息也是肿瘤重要的特征,因此,该研究在原始RGB三通道图片的基础上加用核特征通道(由核特征提取集训练获得),共4通道输入图片,以提高预测效能。最终模型不仅在肝癌切除患者中有显著的预测效能,在肝癌肝移植受者中也具有一定的预测效能,在肝癌手术治疗预后预测方面具有临床应用价值。


该研究提出了MIL在病理切片标注方面的应用价值,同时在数据输入方面增加了细胞核特征信息,这些策略在病理切片人工智能研究方面值得借鉴。然而,该研究是项回顾性研究,且病理切片制作流程与染色深浅均对模型的普适性有一定影响,因此还需要多中心、前瞻性研究,进一步提高模型的预测能力,进而为临床广泛应用提供基础。


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专家简介


徐骁,教育部长江学者奖励计划特聘教授,国家杰出青年科学基金获得者,国家万人计划科技创新领军人才,浙江大学求是特聘教授,肝胆胰外科主任医师、博士生导师,浙江大学医学院附属杭州市第一人民医院院长、党委副书记,浙江省肿瘤融合研究与智能医学重点实验室主任。


现任中华医学会器官移植学分会副主任委员兼肝移植学组组长、中国医师协会器官移植医师分会副会长兼总干事、国家肝脏移植质控中心副主任、国家人体捐献器官获取质控中心副主任委员、浙江省抗癌协会肿瘤精准诊治专业委员会主任委员、浙江省医学会器官移植学分会候任主任委员等。


长期从事肝胆胰外科、肝移植临床和教学工作,致力于移植肿瘤学及肝胆胰恶性肿瘤精准诊治研究。主持国家重点研发项目、国家科技重大专项、“863 ”计划课题、国家杰出青年科学基金、国家自然科学基金重点项目等。以通讯作者或第一作者作者在Gut,J Hepatol等学术期刊发表SCI论文100余篇。主编、主译或参与编写《器官移植学名词》、《器官移植学》、《临床医学导论》及《外科学》等多部国家级规划教材和专著,作为第一完成人荣获浙江省科学技术进步一等奖、浙江省教师教学创新大赛特等奖和中华医学科学技术二等奖,并作为主要完成人之一多次荣获国家科技进步创新团队奖、一等奖及二等奖。


专家门诊信息:

肝胆胰疾病多学科协作诊治门诊(徐骁教授团队):浙江大学医学院附属杭州市第一人民医院,每周三上午

徐骁教授,浙江大学医学院附属杭州市第一人民医院,每周一上午

刘治坤副主任医师:浙江大学医学院附属杭州市第一人民医院,每周三上午

参考文献:

[1] Liu Z, Liu Y, Zhang W, et al. Deep learning for prediction of hepatocellular carcinoma recurrence after resection or liver transplantation: a discovery and validation study. Hepatol Int. 2022 Mar 29.


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