肿瘤基因检测阴性怎么办?

肿瘤基因检测阴性怎么办?
          原创
      悸动初霁
      悸动初霁              
  2025年09月02日 14:23
      四川
  这是一个行业从业人员或患者及患者家属都会非常关注的问题。肿瘤基因检测结果为“阴性”(通常指未发现已知的致病性基因突变)可能由多种因素导致。需要注意的是,“阴性”结果并不等于“没有基因变异”,它更准确的解读是“在本次检测的范围内,未发现与当前临床意义明确相关的特定基因变异”。以下是导致透明细胞肾癌基因检测阴性的一些主要原因,可以从技术、生物学和临床三个层面来理解:一、 技术性原因(与检测方法本身有关)👀检测范围限制(Panel大小):基因检测通常使用“基因包”(Panel)进行,不同Panel包含的基因数量不同。如果使用的是只包含少数几个核心基因(如仅检测 EGFR、KRAS、BRAF)的小Panel,可能会错过其他罕见但致病的不在Panel内的基因突变。解决方案:使用更大Panel或全外显子组测序(WES)可能会发现更多线索。
👀检测技术的局限性:灵敏度不足:检测方法(如NGS)有一定的检测下限。如果肿瘤细胞在样本中的比例过低(低于方法的检测限),微弱的突变信号可能无法被捕获,从而被报告为阴性。这被称为“肿瘤细胞含量不足”或“纯度不够”。大型片段缺失或重排:涉及整个基因或大片染色体区域的缺失。无法检测的变异类型:常规NGS可能擅长检测点突变和小片段的插入/缺失,但对一些特殊类型的变异不敏感,例如:(1)大型片段缺失或重排:涉及整个基因或大片染色体区域的缺失。(2)基因启动子区的变异或深度内含子区的变异(这些可能影响基因表达,但不在常规测序范围内)。(3)染色体非整倍体(如整个某条染色体的获得或整个某条染色体的缺失)是某些肿瘤的特征,但这不属于通常意义上的“基因突变”,常规基因突变报告可能不会强调这一点。解决方案:结合染色体拷贝数变异(CNV)分析和生物信息学算法优化来检测这些特殊变异。
👀样本质量问题:使用的肿瘤样本可能因为固定时间过长(如福尔马林固定)、保存不当或降解,导致DNA严重断裂或损伤,测序结果质量差,无法准确判断变异。解决方案:确保使用新鲜、处理规范的肿瘤组织样本。
二、 生物学原因(与肿瘤本身有关)👀抑癌基因失活的替代机制:肿瘤存在一些基因通路的功能失活,但这不总是由某些基因本身的突变引起。表观遗传学沉默:驱动基因的启动子发生高甲基化,导致基因被“关闭”而不表达,但DNA序列本身没有改变。常规DNA测序无法检测到这种变化,需要特殊的甲基化检测方法。解决方案:进行甲基化分析。
👀肿瘤异质性:肿瘤内部不同区域的细胞可能具有不同的基因突变。活检或手术取样的组织可能只代表了肿瘤的一部分,如果恰好取到了没有驱动基因突变的区域,检测结果就会是阴性。解决方案:多次或多区域取样可能提高检出率,但临床上难以实现。
👀未知基因或未知机制:科学对癌症的认识仍在发展中。可能存在一些尚未被发现的、导致肿瘤发生发展的其他基因或生物学通路。解决方案:随着科研进展,新的致病基因会被不断发现。
👀误诊:极少数情况下,病理诊断可能错误,例如SCLC诊断成NSCLC)。解决方案:复核病理切片,必要时进行免疫组化(IHC)或FISH检测以排除其他亚型。
三、 临床与报告解读原因👀意义未明变异(VUS):检测可能发现了基因变异,但根据现有知识,无法明确判断该变异是致病的( pathogenic)还是良性的(benign)。这类变异通常被报告为“意义未明”(Variant of Uncertain Significance, VUS)。在临床报告中,VUS通常被视为“阴性”,因为不能用于指导治疗或遗传咨询。但这实际上是“不确定”而非真正的“阴性”。解决方案:与遗传咨询师或医生详细讨论VUS的含义。
👀遗传性与体细胞突变:基因检测通常关注的是肿瘤组织中的体细胞突变(后天获得,仅存在于肿瘤细胞中)。如果怀疑有遗传性肿瘤综合征(如VHL综合征),需要进行胚系突变检测(通过血液或唾液样本),检测的是先天遗传的所有细胞都有的突变。如果只做了肿瘤组织的体细胞检测,可能会错过胚系突变。
🌝总结与建议如果您或您的家人遇到这种情况,建议采取以下步骤:与主治医生和遗传咨询师深入沟通:这是最重要的一步。请他们详细解释报告内容,包括:💡检测了哪些基因?💡检测技术的局限性是什么?💡是否有VUS?💡肿瘤细胞含量是否足够?复核病理诊断:确保癌症亚型诊断准确。探讨进一步检测的可能性:💡是否需要补充甲基化检测?💡是否需要补充CNV分析?💡如果怀疑遗传因素,是否需要做胚系突变检测?无需过度焦虑:基因检测阴性并不代表治疗无望。目前肿瘤的治疗除去基于分子标志物(基因、蛋白等)的免疫治疗和靶向治疗治疗之外,还有很多不需基于分子标志物状态的标准治疗方案同样能显著改善肿瘤患者预后。
基因检测是强大的工具,但正确解读其结果需要临床医生和科学家综合考虑所有信息。

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2025-11-09 07:26:08
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